La información sanitaria se ha digitalizado progresivamente en los últimos años, generando expectativas sobre nuevos y mejores usos de los datos más allá de la gestión sanitaria y, especialmente, para la investigación clínica. Aun así, todavía es frecuente que los datos obtenidos en las historias clínicas electrónicas (HCE) sean inaccesibles para los equipos de investigación o no se ajusten al estándar OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership).
InterSystems® OMOP™ ofrece una solución ligera en la nube para canalizar y gestionar los datos. Reúne tres elementos: el estándar
Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR®) utilizado por las HCE; una transformación lista para usar que convierte esos datos al Modelo Común de Datos OMOP (CDM) y un repositorio OMOP en modalidad de software como servicio. Con estos datos, las organizaciones también pueden aprovechar la comunidad y las herramientas de Observational Health Data Sciences and Informatics (OHDSI) para reforzar sus líneas de investigación.
El resultado es un proceso fluido donde la extracción, transformación y carga de información generada en la práctica asistencial, procedente de distintas HCE, se integra en un repositorio OMOP gestionado y actúa como motor de innovación y colaboración con los partners de investigación.
Transformación de datos FHIR en información preparada para OMOP
InterSystems OMOP
La solución InterSystems OMOP se ha desarrollado sobre InterSystems IRIS for Health™, una plataforma completa de salud digital, diseñada para cloud y preparada para trabajar con cualquier estándar de datos sanitarios, incluidos HL7® FHIR®.
InterSystems OMOP facilita la investigación clínica a gran escala y la gestión de datos de pacientes mediante:
- El acceso eficiente y escalable a los datos diarios de la HCE: InterSystems OMOP utiliza las capacidades Bulk FHIR estándar de las HCE para actualizar el repositorio OMOP de la organización con los registros de pacientes que cumplen unos criterios definidos de antemano.
- Despliegue rápido para entornos OHDSI: la solución facilita la creación de un repositorio OMOP que permite aprovechas las herramientas OHDSI, todo ello basado en InterSystems IRIS for Health, suministrado en cloud.
- Datos actualizados para la captación de pacientes en ensayos clínicos:las actualizaciones frecuentes de los datos facilitan que los profesionales clínicos y los equipos de investigación identifiquen y capten con mayor rapidez a posibles participantes.
- De la HCE a datos para investigación, sin desarrollo a medida: InterSystems OMOP incluye un flujo de datos sin código, con reglas de conversión preconfiguradas de FHIR al Modelo Común de Datos OMOP (CDM). De este modo, la información de la HCE queda estructurada para su uso en investigación y se reducen los costes de mantenimiento de los procesos ETL.
- Supervisión continua de la calidad de los datos: los paneles de control de la calidad de los datos y los resúmenes de métricas garantizan la identificación de problemas con la calidad de los datos para corregirlos en su origen.
Principales características
- Convierte y actualiza automáticamente los datos de HCE en OMOP a diario, sin necesidad de desarrollos complejos ETL.
- Utiliza el estándar Bulk FHIR, ampliamente adoptado por los proveedores de HCE.
- Despliegue rápido de un entorno OHDSI con suscripción basada en la capacidad contratada
- Garantiza la seguridad y el cumplimiento de la normativa aprovechando las mejores prácticas de los proveedores de la nube.
- Disponibilidad del panel de calidad de los datos, para supervisar su calidad antes de transformarlos desde FHIR al estándar OMOP.
- Activar la actualización incremental de datos solo para los pacientes con información nueva.
- Disponibilidad inmediata de una correspondencia terminológica común con la ontología OMOP y compatibilidad con la correspondencia terminológica local.
- Para la transformación se puede utilizar el mapeo terminológico local.
- Los recursos FHIR comunes se asignan a OMOP CDM 5.4 de forma inmediata.
- Integrar InterSystems IRIS como nueva opción de base de datos OMOP para las herramientas OHDSI, así como el envío de datos al repositorio OMOP existente.
- Protección avanzada de la privacidad del paciente.
Actualización, supervisión y gestión de los datos de investigación
en un entorno OMOP basado en la nube
en un entorno OMOP basado en la nube
Correspondencias FHIR-OMOP listas para usar
FHIR es un estándar en evolución. Actualmente, InterSystems OMOP ofrece correspondencias preconfiguradas entre recursos FHIR estándar y tablas del modelo común de datos OMOP (OMOP CDM), como se muestra en la tabla siguiente. La correspondencia cumple la guía de implementación de OHDSI para FHIR a OMOP.
| Recurso FHIR | Tabla OMOP |
| Patient | Person, Location, Death |
| Encounter | Visit_occurence |
| Condition, Allergy, Intolerance | Condition_occurence, Measurement, Observation, Procedure_occurence |
| Observation | Observation, Measurement, Condition_occurence, Procedure_occurence, Death |
| Location, Organization | Care_site |
| Practitioner | Provider, Location |
| Procedure | Procedure_occurence, Condition_occurence, Measurement, Observation |
| MedicationAdministration, MedicationRequest, Immunization | Drug_exposure |
Implantado como solución en la nube
InterSystems OMOP Platform opera como software como servicio suministrada y gestionada por InterSystems. Los usuarios pueden crear varios despliegues, dimensionados, gestionados y accesibles de forma independiente.
Los servicios incluyen:
- Plataforma inclusiva con todos los recursos de la infraestructura y el software necesarios para que funcione de forma fluida.
- El equipo de servicios gestionados administra las nuevas implantaciones
- Acceso al InterSystems Cloud Portal, donde los usuarios pueden organizar y supervisar sus implantaciones OMOP.
- Acceso y uso completo de las versiones más recientes de las bibliotecas cliente.
- Disponible en las principales plataformas de hiperescalado.
- Programas robustos de seguridad y protección de datos.
- Asistencia 24 horas al día, 7 días a la semana, incluida la supervisión en tiempo real.
Preguntas frecuentes
sobre OMOP e InterSystems
¿Qué es OMOP?
OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) es un modelo común de datos (CDM en sus siglas en inglés) de código abierto. Normaliza el formato y el contenido de los datos observacionales para que puedan utilizarse en análisis a gran escala e investigación clínica.
Con OMOP, los investigadores pueden analizar de forma coherente datos procedentes de distintas fuentes. Esto facilita estudios reproducibles y permite obtener conclusiones clínicas a partir de la información generada durante la asistencia sanitaria habitual.
Al transformar los datos sanitarios al modelo OMOP CDM, las organizaciones sanitarias simplifican el intercambio de datos, aceleran la investigación y pueden participar en estudios entre instituciones. Todo ello con mayor interoperabilidad y coherencia entre sistemas y fuentes de información sanitaria.
Con OMOP, los investigadores pueden analizar de forma coherente datos procedentes de distintas fuentes. Esto facilita estudios reproducibles y permite obtener conclusiones clínicas a partir de la información generada durante la asistencia sanitaria habitual.
Al transformar los datos sanitarios al modelo OMOP CDM, las organizaciones sanitarias simplifican el intercambio de datos, aceleran la investigación y pueden participar en estudios entre instituciones. Todo ello con mayor interoperabilidad y coherencia entre sistemas y fuentes de información sanitaria.
¿Qué tienen de particular los datos de investigación?
Los datos de investigación, especialmente en el ámbito sanitario, son muy diversos y complejos. Proceden de múltiples fuentes, como las historias clínicas electrónicas, los sistemas de laboratorio y los dispositivos médicos. Además, cada una de estas fuentes utiliza formatos y normas diferentes.
Los datos para la investigación deben normalizarse para garantizar que sean comparables y utilizables en todas las instituciones, y esto puede implicar un proceso largo y propenso a errores. La naturaleza sensible de los datos sanitarios también exige estrictas medidas de privacidad y cumplimiento, algo que añade un nivel de complejidad más a su manejo. Estos retos exigen soluciones que automaticen la extracción, transformación y normalización de datos para garantizar la interoperabilidad y la escalabilidad
Los datos para la investigación deben normalizarse para garantizar que sean comparables y utilizables en todas las instituciones, y esto puede implicar un proceso largo y propenso a errores. La naturaleza sensible de los datos sanitarios también exige estrictas medidas de privacidad y cumplimiento, algo que añade un nivel de complejidad más a su manejo. Estos retos exigen soluciones que automaticen la extracción, transformación y normalización de datos para garantizar la interoperabilidad y la escalabilidad
¿Qué es InterSystems OMOP?
InterSystems OMOP es una solución integral "todo en uno" de canalización y repositorio de datos de investigación que automatiza la extracción, transformación y carga (ETL) de datos en el repositorio OMOP CDM de destino, para apoyar la investigación clínica a gran escala con interoperabilidad y escalabilidad superiores.
Construida sobre la plataforma InterSystems IRIS®, la solución ofrece mapeo FHIR a OMOP listo para usar, mapeo terminológico, transformación a nivel de paciente para actualización diaria, monitorización de calidad de datos, informe de errores e implementación nativa en la nube.
Construida sobre la plataforma InterSystems IRIS®, la solución ofrece mapeo FHIR a OMOP listo para usar, mapeo terminológico, transformación a nivel de paciente para actualización diaria, monitorización de calidad de datos, informe de errores e implementación nativa en la nube.
¿Por qué es crucial el control de la calidad de los datos en la gestión de la investigación sanitaria?
La precisión de los datos es crucial en la investigación sanitaria. Incluso el aparentemente más mínimo error puede distorsionar los resultados, comprometer la seguridad del paciente y conducir a tratamientos ineficaces. Los datos fiables garantizan que los resultados de la investigación sean prácticos y dignos de confianza, lo que impulsa mejores decisiones clínicas y avances médicos.
La solución InterSystems OMOP evalúa continuamente la calidad de los datos FHIR dentro del modelo OMOP, identificando lagunas como terminología o códigos no reconocidos. Los datos que faltan provocan un error, mientras que los que no son óptimos generan una advertencia. Los informes automatizados supervisan los datos FHIR masivos durante las actualizaciones periódicas, lo que facilita que los investigadores aborden los problemas de calidad de los datos de manera eficiente.
La solución InterSystems OMOP evalúa continuamente la calidad de los datos FHIR dentro del modelo OMOP, identificando lagunas como terminología o códigos no reconocidos. Los datos que faltan provocan un error, mientras que los que no son óptimos generan una advertencia. Los informes automatizados supervisan los datos FHIR masivos durante las actualizaciones periódicas, lo que facilita que los investigadores aborden los problemas de calidad de los datos de manera eficiente.
¿Cómo mejora InterSystems OMOP la interoperabilidad para la investigación sanitaria?
InterSystems OMOP refuerza la interoperabilidad al integrar los estándares FHIR y OMOP y facilita el uso secundario de los datos clínicos.
FHIR se está consolidando como estándar para intercambiar información sanitaria. Su adopción crece en organizaciones sanitarias e instituciones de investigación que necesitan trabajar con datos sanitarios de forma más estructurada y reutilizable.
InterSystems OMOP simplifica la correspondencia entre los datos FHIR y el modelo común de datos OMOP. Esto resulta clave para generar evidencias basada en los datos de la asistencia sanitaria habitual y avanzar en la investigación clínica.
Además, InterSystems OMOP facilita definir parámetros de conexión a repositorios OMOP externos. Así, los datos pueden transferirse directamente a un repositorio OMOP y encajar más fácilmente en entornos donde ya conviven distintos sistemas.
FHIR se está consolidando como estándar para intercambiar información sanitaria. Su adopción crece en organizaciones sanitarias e instituciones de investigación que necesitan trabajar con datos sanitarios de forma más estructurada y reutilizable.
InterSystems OMOP simplifica la correspondencia entre los datos FHIR y el modelo común de datos OMOP. Esto resulta clave para generar evidencias basada en los datos de la asistencia sanitaria habitual y avanzar en la investigación clínica.
Además, InterSystems OMOP facilita definir parámetros de conexión a repositorios OMOP externos. Así, los datos pueden transferirse directamente a un repositorio OMOP y encajar más fácilmente en entornos donde ya conviven distintos sistemas.
¿Por qué InterSystems OMOP es tan adecuado para las colaboraciones de investigación regionales y nacionales?
InterSystems OMOP resulta especialmente adecuado para colaboraciones de investigación regionales y nacionales. Aborda aspectos clave como los procesos ETL (Extract, Transform, Load) y la calidad de los datos, al tiempo que favorece la interoperabilidad basada en FHIR.
A medida que las iniciativas regionales y nacionales adoptan estándares FHIR crece la necesidad de integrar OMOP de forma eficiente. Es el caso de las normas de interoperabilidad de CMS en EE. UU. y de iniciativas europeas como EHDS y DARWIN.
InterSystems OMOP proporciona una solución nativa en la nube que acelera el intercambio de datos y la colaboración. Además, se ajusta a los estándares emergentes y reduce las barreras de entrada en proyectos de investigación a gran escala.
También ofrece opciones para incorporar vocabularios estándar de OMOP o archivos de correspondencia con terminologías locales. De este modo, responde a las necesidades regionales y locales en entornos de investigación colaborativa.
A medida que las iniciativas regionales y nacionales adoptan estándares FHIR crece la necesidad de integrar OMOP de forma eficiente. Es el caso de las normas de interoperabilidad de CMS en EE. UU. y de iniciativas europeas como EHDS y DARWIN.
InterSystems OMOP proporciona una solución nativa en la nube que acelera el intercambio de datos y la colaboración. Además, se ajusta a los estándares emergentes y reduce las barreras de entrada en proyectos de investigación a gran escala.
También ofrece opciones para incorporar vocabularios estándar de OMOP o archivos de correspondencia con terminologías locales. De este modo, responde a las necesidades regionales y locales en entornos de investigación colaborativa.
¿Qué ventajas aporta InterSystems OMOP?
Las organizaciones dedicadas a la investigación pueden aumentar los ingresos procedentes de su actividad porque los investigadores dedicarán menos tiempo a crear repositorios de datos y a establecer el acceso a ellos desde sus sistemas.
Los investigadores y científicos de datos acceden a datos de alta calidad para generar análisis y desarrollar modelos de IA, sin que la organización tenga que mantener scripts ETL a medida.
Los equipos sanitarios y de investigación también pueden trabajar con datos actualizados a diario, lo que facilita nuevos usos de OMOP, como la selección de pacientes para ensayos clínicos o el seguimiento de la calidad asistencial, especialmente en proyectos en los que participan varias instituciones.
Aunque el modelo de datos OMOP no almacena la mayor parte de la información sanitaria protegida (PHI), InterSystems OMOP ofrece la posibilidad de suprimir elementos de datos adicionales, como la dirección del paciente, el identificador del profesional sanitario o la información del centro, para reforzar la protección de la privacidad del paciente en estos casos de uso.
Los investigadores y científicos de datos acceden a datos de alta calidad para generar análisis y desarrollar modelos de IA, sin que la organización tenga que mantener scripts ETL a medida.
Los equipos sanitarios y de investigación también pueden trabajar con datos actualizados a diario, lo que facilita nuevos usos de OMOP, como la selección de pacientes para ensayos clínicos o el seguimiento de la calidad asistencial, especialmente en proyectos en los que participan varias instituciones.
Aunque el modelo de datos OMOP no almacena la mayor parte de la información sanitaria protegida (PHI), InterSystems OMOP ofrece la posibilidad de suprimir elementos de datos adicionales, como la dirección del paciente, el identificador del profesional sanitario o la información del centro, para reforzar la protección de la privacidad del paciente en estos casos de uso.
¿Cómo podemos empezar?
El primer paso es elegir al socio adecuado.
InterSystems es líder en salud digital desde sus orígenes. Conoce la complejidad de los datos sanitarios y la importancia de que la información fluya sin fricciones entre distintos sistemas y plataformas.
Su experiencia en interoperabilidad de datos sanitarios facilita la integración y el acceso a la información necesaria para mejorar la coordinación asistencial y la eficiencia operativa.
Al colaborar con InterSystems, las organizaciones cuentan con un socio tecnológico de confianza y con soluciones de tecnología sanitaria fiables, eficientes y preparadas para sus necesidades.
InterSystems es líder en salud digital desde sus orígenes. Conoce la complejidad de los datos sanitarios y la importancia de que la información fluya sin fricciones entre distintos sistemas y plataformas.
Su experiencia en interoperabilidad de datos sanitarios facilita la integración y el acceso a la información necesaria para mejorar la coordinación asistencial y la eficiencia operativa.
Al colaborar con InterSystems, las organizaciones cuentan con un socio tecnológico de confianza y con soluciones de tecnología sanitaria fiables, eficientes y preparadas para sus necesidades.