La información sanitaria se ha digitalizado de forma creciente en los últimos años. Esto ha abierto nuevas posibilidades para aprovechar la información generada en la práctica asistencial más allá de la gestión de la atención sanitaria, en especial para la investigación clínica. Sin embargo, es demasiado frecuente que los datos de las HCE (Historias Clínicas Electrónicas) no sean accesibles o no se ajusten al estándar OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) y los equipos de investigación no puedan acceder a ellos.
InterSystems® OMOP™ ofrece una solución ligera en la nube para canalizar y gestionar datos. Reúne tres elementos: el estándar Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR®) utilizado por las HCE, una transformación lista para usar que convierte esos datos al Modelo Común de Datos OMOP (CDM) y un repositorio OMOP en modalidad de software como servicio. Con estos datos, las organizaciones también pueden aprovechar la comunidad y las herramientas de Observational Health Data Sciences and Informatics (OHDSI) para reforzar sus líneas de investigación.
El resultado es un proceso fluido donde la extracción, transformación y carga de información generada en la práctica asistencial, procedente de distintas HCE, se integra en un repositorio OMOP gestionado y actúa como motor de innovación y colaboración con los partners de investigación.
Transformación de datos FHIR en información preparada para OMOP
InterSystems OMOP
La solución InterSystems OMOP se ha desarrollado sobre InterSystems IRIS for Health™, una plataforma completa de salud digital, diseñada para cloud y preparada para trabajar con cualquier estándar de datos sanitarios, incluidos HL7® FHIR®.
InterSystems OMOP facilita la investigación clínica a gran escala y la gestión de datos de pacientes mediante:
- El acceso eficiente y escalable a los datos diarios de la HCE: InterSystems OMOP utiliza las capacidades Bulk FHIR estándar de las HCE para actualizar el repositorio OMOP de la organización con los registros de pacientes que cumplen unos criterios definidos de antemano.
- Despliegue rápido para entornos OHDSI: la solución facilita la creación de un repositorio OMOP que permite aprovechas las herramientas OHDSI, todo ello basado en InterSystems IRIS for Health, suministrado en cloud.
- Datos actualizados para la captación de pacientes en ensayos clínicos:las actualizaciones frecuentes de los datos facilitan que los profesionales clínicos y los equipos de investigación identifiquen y capten con mayor rapidez a posibles participantes.
- De la HCE a datos para investigación, sin desarrollo a medida: InterSystems OMOP incluye un flujo de datos sin código, con reglas de conversión preconfiguradas de FHIR al Modelo Común de Datos OMOP (CDM). De este modo, la información de la HCE queda estructurada para su uso en investigación y se reducen los costes de mantenimiento de los procesos ETL.
- Supervisión continua de la calidad de los datos: los paneles de control de la calidad de los datos y los resúmenes de métricas garantizan la identificación de problemas con la calidad de los datos para corregirlos en su origen.
Principales características
- Convierte y actualiza automáticamente los datos de HCE en OMOP a diario, sin necesidad de desarrollos complejos ETL.
- Utiliza el estándar Bulk FHIR, ampliamente adoptado por los proveedores de HCE.
- Despliegue rápido de un entorno OHDSI con suscripción basada en la capacidad contratada
- Garantiza la seguridad y el cumplimiento de la normativa aprovechando las mejores prácticas de los proveedores de la nube.
- Disponibilidad del panel de calidad de los datos, para supervisar su calidad antes de transformarlos desde FHIR al estándar OMOP.
- Activar la actualización incremental de datos solo para los pacientes con información nueva.
- Disponibilidad inmediata de una correspondencia terminológica común con la ontología OMOP y compatibilidad con la correspondencia terminológica local.
- Para la transformación se puede utilizar el mapeo terminológico local.
- Los recursos FHIR comunes se asignan a OMOP CDM 5.4 de forma inmediata.
- Integrar InterSystems IRIS como nueva opción de base de datos OMOP para las herramientas OHDSI, así como el envío de datos al repositorio OMOP existente.
- Protección avanzada de la privacidad del paciente.
Actualización, supervisión y gestión de los datos de investigación
en un entorno OMOP basado en la nube
en un entorno OMOP basado en la nube
Mapeo inmediato de datos
FHIR es una norma en evolución. En la actualidad, InterSystems OMOP ofrece mapeos listos para usar desde los recursos FHIR estándar a las tablas OMOP CDM, como se muestra en la siguiente tabla. El mapeo cumple con la Guía de Implementación de OHDSI FHIR a OMOP.
| Recurso FHIR | Tabla OMOP |
| Patient | Person, Location, Death |
| Encounter | Visit_occurence |
| Condition, Allergy, Intolerance | Condition_occurence, Measurement, Observation, Procedure_occurence |
| Observation | Observation, Measurement, Condition_occurence, Procedure_occurence, Death |
| Location, Organization | Care_site |
| Practitioner | Provider, Location |
| Procedure | Procedure_occurence, Condition_occurence, Measurement, Observation |
| MedicationAdministration, MedicationRequest, Immunization | Drug_exposure |
Implantado como solución en la nube
InterSystems OMOP Platform es una oferta de software como servicio suministrada y gestionada por InterSystems. Los usuarios pueden crear varios despliegues, dimensionados, gestionados y accesibles de forma independiente.
Los serviicos incluyen:
- Plataforma inclusiva con todos los recursos de infraestructura y software necesarios para un funcionamiento fluido
- El equipo de servicios gestionados se encarga de administrar las nuevas implantaciones
- Acceso al InterSystems Cloud Portal, donde los usuarios pueden organizar y supervisar sus implantaciones de la Plataforma OMOP
- Acceso y uso completo de las versiones más recientes de las bibliotecas cliente.
- Disponible en las principales plataformas de hiperescalado
- Programas robustos de seguridad y protección de datos
- Asistencia 24 horas al día, 7 días a la semana, incluida la supervisión en tiempo real
Preguntas frecuentes
sobre OMOP e InterSystems
¿Qué es OMOP?
OMOP (Observational Medical Outcomes Partnership) es un modelo de datos común (MDC) de código abierto. Fue diseñado para estandarizar el formato y el contenido de los datos observacionales para el análisis a gran escala y la investigación clínica. Facilita que los equipos de investigación analicen distintas fuentes de datos con criterios homogéneos, mejora la capacidad de realizar estudios reproducibles y contribuye a generar evidencia basada en información recogida en la práctica habitual. Al integrar los datos sanitarios en el OMOP CDM, las instituciones pueden agilizar el intercambio de datos, acelerar la investigación y permitir la realización de estudios interinstitucionales, garantizando al mismo tiempo la interoperabilidad y coherencia de los datos entre los distintos sistemas y fuentes sanitarios.
¿Qué tienen de particular los datos de investigación?
Los datos de investigación, especialmente en el ámbito sanitario, son muy diversos y complejos. Procede de múltiples fuentes, como los historiales médicos electrónicos, los sistemas de laboratorio y los dispositivos médicos, cada uno de los cuales utiliza formatos y normas diferentes. Además, los datos de investigación deben normalizarse para garantizar que sean comparables y utilizables en todas las instituciones, lo que puede ser un proceso largo y propenso a errores. La naturaleza sensible de los datos sanitarios también exige estrictas medidas de privacidad y cumplimiento, lo que añade otro nivel de complejidad a su manejo. Estos retos exigen soluciones que automaticen la extracción, transformación y normalización de datos para garantizar la interoperabilidad y la escalabilidad
¿Qué es InterSystems OMOP?
InterSystems OMOP es una solución integral todo en uno de canalización y repositorio de datos de investigación que automatiza la extracción, transformación y carga (ETL) de datos en el repositorio OMOP CDM de destino para apoyar la investigación clínica a gran escala con interoperabilidad y escalabilidad superiores.
Construida sobre la plataforma de datos IRIS® de InterSystems, la solución ofrece mapeo FHIR a OMOP listo para usar, mapeo terminológico, transformación a nivel de paciente para actualización diaria, monitoreo de calidad de datos, reporte de errores e implementación nativa en la nube.
Construida sobre la plataforma de datos IRIS® de InterSystems, la solución ofrece mapeo FHIR a OMOP listo para usar, mapeo terminológico, transformación a nivel de paciente para actualización diaria, monitoreo de calidad de datos, reporte de errores e implementación nativa en la nube.
¿Por qué es crucial el control de la calidad de los datos en la gestión de datos de investigación sanitaria?
La precisión de los datos es crucial en la investigación sanitaria, ya que incluso pequeños errores pueden distorsionar los resultados, comprometer la seguridad del paciente y conducir a tratamientos ineficaces. Unos datos fiables garantizan que los resultados de la investigación sean procesables y fiables, lo que impulsa mejores decisiones clínicas y avances médicos.
La solución InterSystems OMOP evalúa continuamente la calidad de los datos FHIR dentro del modelo OMOP, identificando lagunas como terminología o códigos no reconocidos. Los datos que faltan provocan un error, mientras que los que no son óptimos generan una advertencia. Los informes automatizados supervisan los datos FHIR masivos durante las actualizaciones periódicas, lo que permite a los investigadores abordar fácilmente los problemas de calidad de los datos.
La solución InterSystems OMOP evalúa continuamente la calidad de los datos FHIR dentro del modelo OMOP, identificando lagunas como terminología o códigos no reconocidos. Los datos que faltan provocan un error, mientras que los que no son óptimos generan una advertencia. Los informes automatizados supervisan los datos FHIR masivos durante las actualizaciones periódicas, lo que permite a los investigadores abordar fácilmente los problemas de calidad de los datos.
¿Cómo mejora InterSystems OMOP la interoperabilidad para la investigación sanitaria?
InterSystems OMOP apoya la interoperabilidad integrando los estándares FHIR y OMOP para facilitar el uso secundario de los datos clínicos. FHIR se está convirtiendo en el estándar para el intercambio de datos clínicos, y su adopción está aumentando en los sistemas sanitarios y las instituciones de investigación. InterSystems OMOP agiliza la asignación de datos FHIR al modelo de datos común OMOP, que es esencial para el desarrollo de pruebas de alta calidad en el mundo real y el avance de la investigación clínica. Los usuarios también pueden especificar parámetros de conexión a repositorios OMOP externos dentro de InterSystems OMOP, lo que permite que los datos fluyan directamente a un repositorio OMOP existente, apoyando aún más la integración sin fisuras entre sistemas.
¿Por qué InterSystems OMOP es tan adecuado para las colaboraciones de investigación regionales y nacionales?
InterSystems OMOP es ideal para colaboraciones de investigación regionales y nacionales debido a su capacidad para abordar retos clave como ETL y la calidad de los datos, al tiempo que admite la interoperabilidad basada en FHIR. A medida que los esfuerzos regionales y nacionales, como las normas de interoperabilidad CMS en EE.UU. y las iniciativas europeas como EHDS y DARWIN, adoptan las normas FHIR, crece la demanda de una integración OMOP eficiente. InterSystems OMOP proporciona una solución nativa en la nube que acelera el intercambio de datos y la colaboración, cumpliendo con los estándares emergentes y reduciendo las barreras de entrada para los esfuerzos de investigación a gran escala. También ofrece al usuario la posibilidad de añadir vocabularios OMOP estándar o archivos de asignación de terminología local, para satisfacer las necesidades regionales y locales en entornos de investigación colaborativa.
¿Qué ventajas aportaría InterSystems OMOP?
Las instituciones de investigación pueden aumentar los ingresos procedentes de las actividades de investigación, ya que los investigadores pueden dedicar menos tiempo a crear repositorios de datos y establecer el acceso a los datos desde los sistemas de HCE. Los investigadores y científicos de datos pueden acceder a datos de alta calidad para crear análisis y desarrollar modelos de IA, mientras que la organización ya no necesita mantener scripts ETL personalizados. Los clínicos e investigadores también pueden aprovechar las capacidades de actualización diaria para dar soporte a nuevos casos de uso en OMOP, como el reclutamiento de ensayos y la supervisión de la calidad clínica, especialmente entre distintas instituciones. Aunque el modelo de datos OMOP no almacena la mayor parte de la información sanitaria protegida (PHI), InterSystems OMOP permite a los usuarios suprimir elementos de datos adicionales -como la dirección del paciente, el identificador del proveedor o la información del centro- para apoyar aún más la protección de la privacidad del paciente en estos casos de uso.
¿Cómo podemos empezar?
El primer paso es encontrar el socio adecuado.
InterSystems ha sido líder en salud digital desde sus inicios. Comprendemos la complejidad de los datos sanitarios y la importancia de un intercambio de datos fluido entre diversos sistemas y plataformas. Nuestra experiencia en interoperabilidad de datos sanitarios garantiza que las organizaciones puedan integrar y acceder fácilmente a los datos adecuados, mejorando la coordinación asistencial y la eficiencia operativa. Al asociarse con InterSystems, las organizaciones se benefician de un proveedor de soluciones de confianza, así como de soluciones de TI sanitarias dedicadas, fiables y eficientes.
InterSystems ha sido líder en salud digital desde sus inicios. Comprendemos la complejidad de los datos sanitarios y la importancia de un intercambio de datos fluido entre diversos sistemas y plataformas. Nuestra experiencia en interoperabilidad de datos sanitarios garantiza que las organizaciones puedan integrar y acceder fácilmente a los datos adecuados, mejorando la coordinación asistencial y la eficiencia operativa. Al asociarse con InterSystems, las organizaciones se benefician de un proveedor de soluciones de confianza, así como de soluciones de TI sanitarias dedicadas, fiables y eficientes.