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InterSystems OMOP

基于云的FHIR到OMOP的真实世界数据解决方案

Mature female doctor using laptop in hospital corridor

InterSystems OMOP 简介

近年来,医疗保健数据的数字化程度越来越高,这使人们希望在医疗保健管理之外更好地利用真实世界的数据,尤其是用于临床研究。

然而,电子健康记录(Electronic Health Record,EHR)数据常常无法为研究团队所用,或是与行业标准的观察性医疗结果合作伙伴关系(Observational Medical Outcomes Partnership,OMOP)通用数据模型(Common Data Model,CDM)契合度不佳。

InterSystems® OMOP™ 提供了一种轻量级的、基于云的数据管道和管理解决方案,该方案将电子健康记录的标准—— 快速医疗保健互操作性资源(Fast Healthcare Interoperability Resources,FHIR®)与InterSystems的开箱即用式CDM转换功能和软件即服务(Software-as-a-Service,SaaS)的OMOP存储库相结合。

借助这些数据,您还可以利用观察性健康数据科学与信息学(Observational Health Data Sciences and Informatics,OHDSI)社区及工具,进一步推进您的研究计划。

试想这样一个无缝流程:从各种EHR系统中提取、转换并加载真实世界数据至托管的OMOP存储库,这一流程将成为推动创新以及与您的研究合作伙伴开展协作的催化剂。

InterSystems OMOP 简介

基于 InterSystems IRIS for Health™构建,这是一个完整的云优先数据平台,可以更轻松地构建和部署连接数据和应用孤岛的高性能人工智能应用。

InterSystems OMOP 通过以下功能支持大规模临床研究和患者数据管理:

  • 高效、可扩展地访问EHR数据:InterSystems OMOP 利用EHR的标准批量 FHIR 功能,每天更新 OMOP 存储库中符合条件的患者记录。
  • 针对 OHDSI 环境的快速部署:启动 OMOP 资源库并利用 OHDSI 工具,所有这些都基于 InterSystems IRIS for Health(医疗版)数据平台,并在 AWS 云环境中交付。
  • 为试验招募提供及时的数据:频繁的数据更新使临床医生和研究人员能够更迅速地识别并招募潜在的试验参与者。 在医疗护理结束后立即联系候选人,可能会提高他们的参与意愿。
  • 开箱即用的 EHR 到研究转化:无代码数据管道提供从 FHIR 到 OMOP CDM 的标准映射,将 EHR 数据转化为研究级信息,降低 ETL (抽取、转换和加载)维护成本。
  • 持续的数据质量监控:数据质量仪表盘和汇总指标可确保从源头及时发现和纠正数据质量问题。
close up of person looking at data on device

主要功能

  • 每天自动将 EHR 数据转换并刷新到 OMOP 中,无需进行复杂的 ETL 开发。
  • 利用 EHR 供应商广泛采用的 Bulk FHIR 标准。
  • 基于容量订阅定价快速部署OHDSI(观察性健康数据科学与信息学)环境。
  • 利用云计算供应商的最佳实践,确保安全和合规性。
  • 在数据转换前利用数据质量仪表板来检测和监控数据质量。
  • 仅针对有新数据的患者实现数据增量更新。
  • 提供开箱即用的与OMOP本体相匹配的通用术语映射,并支持本地术语映射。
  • 常见的 FHIR 资源开箱即映射到 OMOP。
  • 集成 InterSystems IRIS,将其作为 OHDSI 工具的新 OMOP 数据库选项,并将数据发送到现有的 OMOP 数据库。
  • 支持高级患者隐私保护的选项。

开箱即用的数据映射

FHIR 是一个不断发展的标准。 如今,InterSystems OMOP 提供从标准 FHIR 资源到 OMOP CDM 表的开箱即用映射,如下表所示。

FHIR 资源
OMOP 表
Patient(患者)Person, Location, Death(人物、地点、死亡)
Encounter(就诊)Visit_occurence(就诊记录)
Condition, AllergyIntolerance(疾病、过敏不耐受)Condition_occurence, Measurement, Observation, Procedure_occurence(条件一致性、测量、观察、程序一致性)
Observation(观察)Observation, Measurement, Condition_occurence, Procedure_occurence, Death(观察、测量、条件一致性、程序一致性、死亡)
Location, Organization(地点、机构)Care_site(医疗场所)
Practitioner(执业人员)Provider, Location(医疗机构,地点)
Procedure(程序)Procedure_occurence, Condition_occurence, Measurement, Observation(程序一致性、条件一致性、测量、观察)
MedicationAdministration, MedicationRequest, Immunization(用药管理, 用药申请, 免疫接种)Drug_exposure(药物暴露)

作为云解决方案部署

InterSystems OMOP 是由 InterSystems 交付和管理的 SaaS 产品。 客户可以创建多个独立进行规模配置、管理以及访问的部署实例。

服务内容包括:

  • 包含所有必要的基础设施资源和软件的综合性平台,可实现无缝运行
  • 访问 InterSystems 云门户,客户可在其中创建、管理和监控其 OMOP 部署,并添加新服务
  • 访问并充分利用最新版本的客户端库
  • Amazon Web Services提供
  • 强大的安全和数据保护计划
  • 全天候支持,包括实时监控

关于 OMOP & InterSystems
常见问题

什么是 OMOP?
OMOP(观察性医疗结果伙伴关系)是一个开源的通用数据模型(CDM),旨在为大规模分析和临床研究实现观察性数据的格式与内容的标准化。 它使研究人员能够以一致的方式分析不同的数据源,提高开展可重复研究和生成真实世界证据的能力。 通过将医疗保健数据映射到 OMOP CDM 中,各机构可以简化数据共享流程、加快研究进度并实现跨机构研究,同时确保不同医疗保健系统和数据源之间的数据互操作性和一致性。
研究数据有何独特之处?
研究数据,尤其是医疗保健领域的研究数据,具有高度的多样性和复杂性。 这些信息来自多个来源,如电子健康记录、实验室系统和医疗设备,每个来源都使用不同的格式和标准。 此外,研究数据必须标准化,以确保其在各机构间的可比性和可用性,这可能是一个耗时且容易出错的过程。 医疗保健数据的敏感性还要求采取严格的隐私和合规措施,这又为数据处理增加了一层复杂性。 这些挑战要求解决方案能自动进行数据提取、转换和标准化,以确保互操作性和可扩展性
什么是 InterSystems OMOP?
InterSystems OMOP是一个全面的一体化研究数据管道和存储库解决方案,可自动将数据提取、转换和加载(ETL)到目标OMOP CDM存储库,以卓越的互操作性和可扩展性支持大规模临床研究。

该解决方案基于InterSystems IRIS®数据平台构建,提供开箱即用的FHIR到OMOP映射、术语映射、用于每日刷新的患者级转换、数据质量监控、错误报告和云原生部署功能。
为什么数据质量监控在医疗研究数据管理中至关重要?
准确的数据对医疗保健研究至关重要,因为即使是很小的错误也会扭曲研究结果、危及患者安全并导致无效治疗。 可靠的数据能确保研究结果具有可操作性和可信度,从而推动做出更优的临床决策并促进医学进步。

InterSystems OMOP解决方案可在OMOP模型内持续评估FHIR数据质量,识别出诸如未识别的术语或代码等数据缺口。 缺失数据会引发错误,而次优数据则会产生警告。 自动化报告会在定期更新期间对批量FHIR数据进行监控,使研究人员能够轻松解决数据质量问题。
InterSystems OMOP 如何提高医疗研究的互操作性?
InterSystems OMOP 通过整合 FHIR 和 OMOP 标准来支持互操作性,从而促进临床数据的二次利用。 FHIR 正在成为临床数据共享的标准,在医疗系统和研究机构中的采用率也在不断提高。 InterSystems OMOP 简化了 FHIR 数据与 OMOP 通用数据模型的映射,这对于开发高质量的真实世界证据和推进临床研究至关重要。 用户还可以在 InterSystems OMOP 中指定外部 OMOP 资源库连接参数,使数据能够直接流入现有的 OMOP 资源库,进一步支持跨系统的无缝集成。
为何InterSystems OMOP非常适合区域性和全国性的研究合作?
InterSystems OMOP因其能够应对数据ETL及数据质量等关键挑战,同时支持基于FHIR标准的互操作性,因而非常适合区域性和全国性的研究合作。 随着美国 CMS 互操作性规则等区域性和全国性举措,以及欧洲 EHDS 和 DARWIN 等倡议采用FHIR标准,对高效OMOP整合的需求也在不断增长。 InterSystems OMOP 提供的云原生解决方案可加速数据共享和协作,满足新兴标准的要求,并降低大规模研究工作的准入门槛。 它还为用户提供了添加标准OMOP词汇表或本地术语映射文件的选项,以满足协作研究环境中区域性和本地的需求。
InterSystems OMOP 有哪些优势?
研究机构能够增加研究活动带来的收入,因为研究人员可以减少在构建数据存储库以及 EHR 系统中获取数据上所花费的时间。 研究人员和数据科学家能够获取高质量数据以构建分析模型并开发 AI 模型,同时组织无需再维护定制化的ETL脚本。 临床医生和研究人员还可以利用每日数据更新功能,支持在 OMOP 上开展诸如试验招募和临床质量监测等新应用场景,尤其是在跨不同机构的情况下。 尽管 OMOP 数据模型并不存储大部分受保护的健康信息(PHI),但InterSystems OMOP允许用户屏蔽额外的数据元素(如患者地址、医疗机构标识符或医疗机构信息),以便在这些应用场景中进一步保护患者隐私。
如何开始?
第一步是找到合适的合作伙伴。

InterSystems 自成立以来一直是数字医疗领域的领导者。 我们了解医疗保健数据的复杂性,以及在各种系统和平台之间进行无缝数据交换的重要性。 我们在医疗健康数据互操作性方面的专业知识可确保各组织轻松整合并访问正确的数据,从而改善医疗协同和运营效率。 通过与InterSystems建立合作关系,企业不仅能获得值得信赖的解决方案提供商的支持,还可享用专为其打造的可靠且高效的医疗 IT解决方案。

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